يوجه صندوق التعليم العالي الجامعي مهامه وفق إشراف وإدارة مجلس إدارة صندوق التعليم العالي الجامعي ، إذ يتمتع المجلس بالصلاحيات الكاملة لإدارة الصندوق ووضع السياسة العامة التي يسير عليها ، وإقرار النظم واللوائح المالية والإدارية فيها واعتماد الخطط الاستثمارية والموافقة على تمويل المشاريع واعتماد الميزانية السنوية ، كل ذلك تحت إشراف مباشر من مجلس الإدارة برئاسة معالي وزير التعليم الدكتور حمد بن محمد آل الشيخ
معالي الدكتور حمد بن محمد آل الشيخ
وزير التعليم – رئيس مجلس الادارة
معالي الدكتور بدران بن عبدالرحمن العمر
رئيس جامعة الملك سعود
معالي الدكتور فالح بن رجاء السلمي
رئيس جامعة الملك خالد
معالي الدكتور عبدالرحمن بن عبيد اليوبي
رئيس جامعة الملك عبدالعزيز
سعادة الاستاذ طارق بن عبدالله الشهيّب
وكيل وزارة المالية لشؤون الإيرادات
سعادة الدكتور خالد بن إبراهيم اباالخيل
نائب محافظ المؤسسة العامة للتدريب التقني والمهني للخدمات المساندة
سعادة الاستاذ عبدالله بن عبدالرحمن المعيقل
مستشار وزارة الاقتصاد والتخطيط
سعادة الأستاذ محمد بن عبدالله أبو نيان
رئيس مجلس إدارة شركة أعمال المياه والطاقة الدولية ( أكواباور )
سعادة الأستاذ عبدالعزيز بن عبدالرحمن العريفي
الرئيس التنفيذي للمالية بشركة جدوى للاستثمار
سعادة الأستاذ عبدالمحسن بن عبدالعزيز الفارس
الرئيس التنفيذي والعضو المنتدب لمصرف الإنماء
الدكتور عبدالله بن محمد الدخيل
الامين العام للصندوق أمين مجلس الإدارة